Gobernó Paraguay por 35 años, hubo 425 ejecutados o desaparecidos y casi 20.000 detenidos durante el régimen de Stroessner desde 1954 hasta 1989, la gran mayoría de los cuales fueron víctimas de palizas, picana eléctrica, quemaduras y otras formas de tortura física.
El Gobierno stronista formó parte del Plan Cóndor, un sistema de coordinación de la represión a los opositores a las dictaduras del Cono Sur en las décadas de 1970 y 1980.
Stroessner llegó al poder en 1954 tras un golpe de Estado donde derrocó al entonces presidente Federico Chaves, también del Partido Colorado. Fue derrocado 35 años después por su propio consuegro y mano derecha, el general Andrés Rodríguez.
Falleció el 16 de agosto de 2006 en Brasilia, sin haber sido juzgado por los crímenes cometidos durante su mandato.